MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylocella silvestris BL2 chromosome

Total Repeats: 111304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011666	GAT	2	6	31	36	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011666	G	6	6	135	140	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011666	CGATC	2	10	206	215	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_011666	CAG	2	6	231	236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011666	CGC	2	6	237	242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_011666	GC	4	8	241	248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011666	CGC	3	9	257	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_011666	CGC	2	6	329	334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_011666	AGA	2	6	350	355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011666	GCC	2	6	435	440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217976201
11	NC_011666	GC	3	6	445	450	0 %	0 %	50 %	50 %	217976201
12	NC_011666	CGGA	2	8	510	517	25 %	0 %	50 %	25 %	217976201
13	NC_011666	CGA	2	6	537	542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217976201
14	NC_011666	GCT	2	6	583	588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217976201
15	NC_011666	GCG	2	6	590	595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217976201
16	NC_011666	TCG	2	6	627	632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217976201
17	NC_011666	GC	3	6	666	671	0 %	0 %	50 %	50 %	217976201
18	NC_011666	CG	3	6	673	678	0 %	0 %	50 %	50 %	217976201
19	NC_011666	GC	4	8	723	730	0 %	0 %	50 %	50 %	217976201
20	NC_011666	CAT	2	6	835	840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217976201
21	NC_011666	CGC	2	6	849	854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217976201
22	NC_011666	GGAC	2	8	856	863	25 %	0 %	50 %	25 %	217976201
23	NC_011666	CGG	2	6	885	890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217976201
24	NC_011666	CGC	2	6	913	918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217976201
25	NC_011666	CGC	3	9	931	939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217976201
26	NC_011666	CGTC	2	8	984	991	0 %	25 %	25 %	50 %	217976201
27	NC_011666	CGC	2	6	1049	1054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217976201
28	NC_011666	ATCT	2	8	1058	1065	25 %	50 %	0 %	25 %	217976201
29	NC_011666	CGG	2	6	1068	1073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217976201
30	NC_011666	CGA	2	6	1165	1170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217976201
31	NC_011666	CAG	2	6	1199	1204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217976201
32	NC_011666	CGC	2	6	1258	1263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217976201
33	NC_011666	GCC	2	6	1270	1275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217976201
34	NC_011666	CGA	2	6	1294	1299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217976201
35	NC_011666	CGG	2	6	1342	1347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217976201
36	NC_011666	CGA	2	6	1351	1356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217976201
37	NC_011666	CGC	2	6	1390	1395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217976201
38	NC_011666	CTG	2	6	1502	1507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217976201
39	NC_011666	CGG	2	6	1548	1553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217976201
40	NC_011666	TCG	2	6	1623	1628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217976201
41	NC_011666	CGGC	2	8	1753	1760	0 %	0 %	50 %	50 %	217976201
42	NC_011666	CGG	2	6	1765	1770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217976201
43	NC_011666	ACC	2	6	1781	1786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217976201
44	NC_011666	CGC	2	6	1819	1824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217976201
45	NC_011666	GC	3	6	1833	1838	0 %	0 %	50 %	50 %	217976201
46	NC_011666	GGA	2	6	1843	1848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217976201
47	NC_011666	GGC	2	6	1884	1889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011666	ATC	2	6	1946	1951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217976202
49	NC_011666	ATGGG	2	10	1976	1985	20 %	20 %	60 %	0 %	217976202
50	NC_011666	GC	3	6	2076	2081	0 %	0 %	50 %	50 %	217976202
51	NC_011666	GGC	2	6	2128	2133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217976202
52	NC_011666	GAG	2	6	2138	2143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217976202
53	NC_011666	GC	3	6	2189	2194	0 %	0 %	50 %	50 %	217976202
54	NC_011666	GGCC	2	8	2221	2228	0 %	0 %	50 %	50 %	217976202
55	NC_011666	TCA	2	6	2256	2261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217976202
56	NC_011666	CGT	2	6	2269	2274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217976202
57	NC_011666	ATG	2	6	2309	2314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217976202
58	NC_011666	AGCGA	2	10	2336	2345	40 %	0 %	40 %	20 %	217976202
59	NC_011666	CGC	2	6	2356	2361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217976202
60	NC_011666	GC	3	6	2398	2403	0 %	0 %	50 %	50 %	217976202
61	NC_011666	GCT	2	6	2413	2418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217976202
62	NC_011666	GAT	2	6	2451	2456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217976202
63	NC_011666	TCG	2	6	2474	2479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217976203
64	NC_011666	TCG	2	6	2542	2547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217976203
65	NC_011666	GCC	2	6	2565	2570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217976203
66	NC_011666	CGAT	2	8	2594	2601	25 %	25 %	25 %	25 %	217976203
67	NC_011666	TGC	2	6	2726	2731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217976203
68	NC_011666	GGC	2	6	2772	2777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217976203
69	NC_011666	CG	3	6	2814	2819	0 %	0 %	50 %	50 %	217976203
70	NC_011666	GCGGGG	2	12	2878	2889	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	217976203
71	NC_011666	GCG	2	6	2980	2985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217976203
72	NC_011666	CGC	2	6	2994	2999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217976203
73	NC_011666	GC	4	8	3048	3055	0 %	0 %	50 %	50 %	217976203
74	NC_011666	CG	3	6	3141	3146	0 %	0 %	50 %	50 %	217976204
75	NC_011666	TCG	2	6	3159	3164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217976204
76	NC_011666	CCCAG	2	10	3191	3200	20 %	0 %	20 %	60 %	217976204
77	NC_011666	ATC	2	6	3204	3209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217976204
78	NC_011666	GCG	3	9	3232	3240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217976204
79	NC_011666	GC	3	6	3375	3380	0 %	0 %	50 %	50 %	217976204
80	NC_011666	ATC	2	6	3390	3395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217976204
81	NC_011666	CGA	2	6	3400	3405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217976204
82	NC_011666	CGC	2	6	3407	3412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217976204
83	NC_011666	GAAT	2	8	3456	3463	50 %	25 %	25 %	0 %	217976204
84	NC_011666	GCC	2	6	3471	3476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217976204
85	NC_011666	CGG	2	6	3484	3489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217976204
86	NC_011666	GA	4	8	3501	3508	50 %	0 %	50 %	0 %	217976204
87	NC_011666	TTG	2	6	3556	3561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217976204
88	NC_011666	GCC	2	6	3573	3578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217976204
89	NC_011666	GCC	2	6	3596	3601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217976204
90	NC_011666	CGT	2	6	3655	3660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217976204
91	NC_011666	CGAGC	2	10	3668	3677	20 %	0 %	40 %	40 %	217976204
92	NC_011666	CGA	2	6	3706	3711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217976204
93	NC_011666	GCC	2	6	3722	3727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217976204
94	NC_011666	CAG	2	6	3734	3739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217976204
95	NC_011666	GAT	2	6	3799	3804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217976204
96	NC_011666	GTG	2	6	3852	3857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217976204
97	NC_011666	CGC	2	6	3871	3876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217976204
98	NC_011666	CGA	2	6	3877	3882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217976204
99	NC_011666	CGG	2	6	3898	3903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217976204
100	NC_011666	GC	4	8	3984	3991	0 %	0 %	50 %	50 %	217976204
101	NC_011666	CGC	2	6	4009	4014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217976204
102	NC_011666	GGC	2	6	4019	4024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217976204
103	NC_011666	GCC	2	6	4073	4078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217976204
104	NC_011666	CGG	3	9	4099	4107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217976204
105	NC_011666	GGT	2	6	4118	4123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217976204
106	NC_011666	GGC	2	6	4145	4150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011666	GCGG	2	8	4203	4210	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_011666	GGT	2	6	4252	4257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011666	GGCG	2	8	4261	4268	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
110	NC_011666	GCC	2	6	4341	4346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_011666	GC	3	6	4409	4414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_011666	GCG	2	6	4420	4425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011666	ATG	2	6	4443	4448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011666	GAA	2	6	4454	4459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011666	TCG	2	6	4470	4475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011666	TCA	2	6	4476	4481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011666	GAC	2	6	4483	4488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011666	GGCG	2	8	4522	4529	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_011666	GCG	2	6	4572	4577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011666	CGA	2	6	4627	4632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011666	CG	3	6	4656	4661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_011666	GCA	2	6	4696	4701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011666	CGC	2	6	4714	4719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_011666	CGT	2	6	4726	4731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011666	CGGCA	2	10	4732	4741	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
126	NC_011666	GCG	2	6	4765	4770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011666	GCG	2	6	4839	4844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011666	CTCGCC	2	12	4862	4873	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_011666	GC	3	6	4908	4913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_011666	GAA	2	6	4925	4930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011666	CGG	2	6	4938	4943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011666	GCGATC	2	12	4955	4966	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011666	CG	3	6	4969	4974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_011666	CG	4	8	4992	4999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_011666	GCTCGC	2	12	5032	5043	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
136	NC_011666	CG	3	6	5104	5109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_011666	GGCG	2	8	5117	5124	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
138	NC_011666	GC	3	6	5177	5182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_011666	GCG	2	6	5187	5192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011666	GCCG	2	8	5225	5232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_011666	ATCTC	2	10	5235	5244	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_011666	CGG	2	6	5321	5326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217976205
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144	NC_011666	GC	3	6	5420	5425	0 %	0 %	50 %	50 %	217976205
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151	NC_011666	GCCG	2	8	5653	5660	0 %	0 %	50 %	50 %	217976205
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161	NC_011666	CGC	2	6	6097	6102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
162	NC_011666	GCC	2	6	6110	6115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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269	NC_011666	CGG	2	6	10358	10363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217976210
270	NC_011666	GGC	2	6	10368	10373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217976210
271	NC_011666	AAGC	2	8	10391	10398	50 %	0 %	25 %	25 %	217976210
272	NC_011666	GAT	2	6	10404	10409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217976210
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274	NC_011666	TGAA	2	8	10481	10488	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
275	NC_011666	TCGC	2	8	10509	10516	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
276	NC_011666	A	6	6	10520	10525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_011666	A	6	6	10545	10550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_011666	AGCG	2	8	10570	10577	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
279	NC_011666	TTCA	2	8	10617	10624	25 %	50 %	0 %	25 %	217976211
280	NC_011666	GC	5	10	10632	10641	0 %	0 %	50 %	50 %	217976211
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396	NC_011666	GC	3	6	14927	14932	0 %	0 %	50 %	50 %	217976213
397	NC_011666	CCGC	2	8	14936	14943	0 %	0 %	25 %	75 %	217976213
398	NC_011666	GC	3	6	15000	15005	0 %	0 %	50 %	50 %	217976213
399	NC_011666	AGC	2	6	15031	15036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217976213
400	NC_011666	GATCGC	2	12	15068	15079	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	217976213
401	NC_011666	GC	3	6	15084	15089	0 %	0 %	50 %	50 %	217976213
402	NC_011666	GCG	2	6	15156	15161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217976213
403	NC_011666	CGG	2	6	15201	15206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
404	NC_011666	CGATC	2	10	15275	15284	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
405	NC_011666	ATC	2	6	15427	15432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217976214
406	NC_011666	GTC	2	6	15443	15448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217976214
407	NC_011666	T	6	6	15470	15475	0 %	100 %	0 %	0 %	217976214
408	NC_011666	CGC	3	9	15491	15499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217976214
409	NC_011666	TCGC	2	8	15531	15538	0 %	25 %	25 %	50 %	217976214
410	NC_011666	ACG	2	6	15543	15548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217976214
411	NC_011666	CAT	2	6	15563	15568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217976214
412	NC_011666	GC	3	6	15577	15582	0 %	0 %	50 %	50 %	217976214
413	NC_011666	GTC	2	6	15615	15620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217976214
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421	NC_011666	CG	3	6	15832	15837	0 %	0 %	50 %	50 %	217976214
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427	NC_011666	TGC	2	6	16135	16140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217976214
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434	NC_011666	CG	4	8	16479	16486	0 %	0 %	50 %	50 %	217976214
435	NC_011666	GCT	2	6	16529	16534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217976214
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439	NC_011666	TCG	2	6	16723	16728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217976214
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450	NC_011666	CGC	2	6	17002	17007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217976214
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460	NC_011666	GCC	3	9	17540	17548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217976215
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462	NC_011666	GGC	3	9	17572	17580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217976215
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464	NC_011666	GCC	2	6	17638	17643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
465	NC_011666	CG	3	6	17668	17673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
466	NC_011666	TCC	2	6	17711	17716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
467	NC_011666	GGC	3	9	17722	17730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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482	NC_011666	GTCG	2	8	18338	18345	0 %	25 %	50 %	25 %	217976216
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489	NC_011666	GCC	2	6	18544	18549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217976216
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497	NC_011666	GCG	2	6	18750	18755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217976217
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